Organograma
Área de Correição- ACOR Departamento de Articulação para a Inovação DAPI Coordenação de Contencioso - COCF Diretoria de Inovação- DRIN Assessor - ASSES Assessor-ASSES Assessor - ASSES Diretoria Financeira, de Crédito e Captação DRFC Assessor - ASSES Diretoria de Desenvolvimento Científico e Tecnológico DRCT Departamento de Fiscalização de Convênios Encerrados  - DFIC Coordenação de Cadastro Funcional - CCAF Área de Gestão Financeira da Finep - AGEF Coordenação de Contratos de Tecnologia da Informação (CCTI Departamento de Controle dos Recursos Financeiros e... Departamento de Desenvolvimento Tecnológico e Subvenção... Departamento de Cobrança - DCOB Assessoria Jurídica da Diretoria Financeira e Controladoria... Assessoria Jurídica da Diretoria de Inovação - AJIN Departamento de Tesouraria do FNDCT - DTES2 Departamento de Empreendedorismo e Investimento em Startups... Departamento Regional do Centro Oeste - DRCO Departamento de Investimentos em Fundos e Participações - DIFP Departamento de Química Metalurgia e  Materiais - DQMM Departamento Regional do Sul - DSUL Área de Inovação 4 - AIN4 Departamento de Infraestrutura e Serviços de Tecnologia da... Departamento de  Sistemas e Tecnologia da Informação- DSTI Assessoria Jurídica da Diretoria Administrativa - AJDA Coordenação de Padronização -CPAD Departamento de Administração de Pessoas - DEAP Gabinete da Presidência - GAPR Assessor - ASSES Secretaria Executiva de Comissão 
de Ética Presidência   PRES Departamento de Ambiência e Saúde - DAES Departamento de Petróleo,  Mineração e indústria Naval  - DPMN Departamento de Prestação de Contas da Diretoria de Inovação... Departamento Regional Nordeste (DRNE) Coordenação de Avaliação de Garantias - CGAR Departamento de Gestão e Desenvolvimento de Carreiras - DGEC Departamento de Saúde e Qualidade de Vida  - DSAQ Coordenação Fiscal e de Contas a Pagar (CFIS) Departamento de Recuperação de Crédito - DREC Conselho Fiscal - CFIS Auditoria - AUDI Assembléia Geral AG Área de Infraestrutura e Pesquisa Básica -AIPB Área de Gestão de Pessoas - AGEP Departamento de Agronegócios e Alimentos  - DAGN Departamento de Captação (DCAP) Comitê de Auditoria - COAUD Departamento de Contabilidade da FINEP - DCNT1 Área de Tecnologias da Informação - ATI Departamento Regional do Nordeste - DRNO DEPARTAMENTO DE OPERAÇÕES DE CRÉDITO DESCENTRALIZADAS  - DOCD Área da Controle Orcamentario e Financeiro do FNDCT (ACOF) Departamento de Engenharia Metal Mecânica, Equipamentos,... Departamento de Energia, Tecnologia da Informação, Comunicação... Departamento de Conformidade e Integridade - DCOI Área de Inovação 1 - AIN1 Departamento de Pesquisa Aplicada - DPAP Departamento de Contabilidade do FNDCT - DCNT2 Departamento de Auditoria - DAUD Área de Crédito  - ACRD Área de Inovação 1 - AIN2 Departamento Operacional de São Paulo - DESP Área de Planejamento - APLA Departamento de Prestação de Contas da Diretoria de... Departamento  Regional Sudeste -
DRSE Coordenação de Tomada de Contas Especial -CTCE Área de Pesquisa Aplicada e Desenvolvimento Tecnológico - APDT Coordenação de Gestão Documental e Arquivo -CGDA Área Jurídica - AJUR Assessoria Jurídica da Diretoria de Desenvolvimento Científico... Departamento de Planejamento Financeiro, Orçamentário e de... Área de Logística - ALOG Departamento de Educação e Pesquisa Básica- DEPB Área de Inovação 3 - AIN3 Área de Conformidade, Integridade e Gestão de Riscos  ACIR Departamento de Gestão Integrada de Riscos - DGIR Departamento de Análise de Crédito e GarantiasDCRE Coordenação de Promoção (CPRO) Departamento de Gestão de Produtos e Inovação Corporativa - DGPI Departamento de Projetos Departamento de Gestão Corporativa e Processos - DGCP Departamento de Desenvolvimento e Formulação Estratégica - DDFE Departamento de Infraestrutura de Pesquisa
- DIEP Departamento de Acompanhamento de Operações de Crédito - DAOC Departamento de Soluções e  Governança de TI - DSGO Área de Empreendedorismo e Investimento - AEIN Departamento de Serviços Administrativos - DSAD Diretoria Administrativa – DADM Ouvidoria - OUVI Conselho Consultivo - CCON Conselho de Administração - CADM Departamento de Contratações e Compras Administrativas - DCAD Departamento de Apoio à Gestão Científica e Tecnológica – DACT Departamento de Tesouraria da FINEP-DTES1 Coordenação de Comunicação (CCOM) Departamento de Comunicação e Promoção (DCOP)  Secretaria de Governança (SeGov) Departamento de Cooperação Internacional - (DCIN)