A FINEP mantém convênio com entidades congêneres em três países:

• na Espanha, com o CDTI (Centro para o Desenvolvimento Tecnológico e Industrial);

• na França, com a OSÉO e

• na Alemanha, com a DFG e a Fraunhofer

A FINEP é o organismo gestor no Brasil do programa CYTED - IBEROEKA, juntamente com outras 20 instituições de países iberoamericanos.O IBEROEKA oferece oportunidades de parceiros para projetos inovadores entre empresas dos países participantes.

Há também um acordo de cooperação com a França, por meio de sua agência de inovação, a OSÉO. Entre os objetivos está a promoção de parcerias entre empresas brasileiras e francesas, prioritariamente as pequenas e médias – PMEs.

A FINEP também participa de Comitês Gestores dos Acordos de Cooperação firmados entre o Ministério da Ciência e Tecnologia do Brasil e seus parceiros de outros países.

Dos Programas Multilaterais de Cooperação Internacional do MCT, a FINEP participa nos seguintes Comitês Gestores:

• PROSUL
• PRO-ÁFRICA
• Ciências Sociais CPLP
• B.BICE - Bureau Brasileiro para Ampliação da Cooperação Internacional com a União Européia